Primer Pair Locator --- 引物对 DNA 序列染色体定位。
注意: 单条引物序列(DNA)长度应 ≥ 10 bp 且 ≤ 40 bp。 另外,本服务器较小,因此单个任务仅接受前 30 对有效引物。
数据来源。
未展示的参数将采用默认值。帮助
perc_identity (0..100) -- Percent identity (%) qcov_hsp_perc (0..100) -- Percent query coverage per hsp (%) evalue ≥ 30 bp < 30 bp (Real number) -- Expectation value (E) threshold for saving hits word_size ≥ 30 bp 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 20 24 28 35 < 30 bp 4 5 6 7 8 9 10 11 Word size for wordfinder algorithm (length of best perfect match) dust Filter query sequence with DUST
设置 blastn 的输出格式为 '6' (Tabular),可改变输出格式的 specifiers: Required qseqid sseqid pident qcovhsp sstrand sstart send Optional evalue bitscore score length qcovs qend qlen qstart slen